生命科学领域已步入计算规模化的新阶段。过去十多年,NVIDIA 一直致力于构建全面的 GPU 加速计算技术栈,涵盖硬件、框架、库、模型、微服务及特定领域工具,旨在助力研究人员执行更复杂的流程并加速迭代。
本周,Anthropic 发布了 Claude Science,一个面向科学研究的 AI 工作台,允许科学家通过自然语言与代理进行交互,以端到端的方式完成工作。
Claude Science 集成了 NVIDIA BioNeMo Agent Toolkit,作为科学家在其工作流程中可用的资源。该工具包将 NVIDIA 加速功能打包成可调用的技能,使 Claude Science 能够选择合适的工具、准备有效输入并执行工作流——同时连接到部署在任何地方的 NVIDIA 计算资源。这使得 NVIDIA 的加速模型、库和 NVIDIA NIM 微服务能够直接集成到研究发生的同一环境中。
全球顶尖的制药公司正利用 NVIDIA 技术在药物发现、基因组学、医学影像、分子设计和蛋白质工程等领域推动 AI 赋能的研究。目前,在排名前 20 的制药公司中,有 18 家在使用 NVIDIA BioNeMo,这凸显了其在整个生态系统中的广泛作用。
推动科学发现的代理时代
Claude Science 使科学家能够利用自然语言将研究意图转化为行动,而无需手动配置模型、端点或软件环境。NVIDIA BioNeMo Agent Toolkit 通过提供对 Evo 2、Boltz-2 和 OpenFold 3 等加速工作流和模型的访问,进一步扩展了这一能力,从而加速了受益于加速的分析。
科学家首先以自然语言描述一项研究任务,例如分析基因组序列、预测蛋白质结构或设计潜在的结合剂。Claude Science 会解析请求,并通过预配置的、了解基因组学、蛋白质组学、单细胞分析、化学信息学和临床研究等领域既定工作流的领域专用代理来协调工作。
BioNeMo Agent Toolkit 为这些代理提供了连接每个步骤与适当 NVIDIA 科学能力所需的上下文。每项技能都包含有关其目的和所需输入的信息,帮助代理准备和执行工作流,并返回输出供审查。
最终结果是科学推理与加速计算工作之间的迭代循环。科学家可以在关注科学的同时,检查输出、完善问题并确定下一步。
一个强大的例子是生成更优的常见癌症靶点抑制剂。在此工作流中,科学家从已知的致癌抗原突变开始,并要求 Claude 设计多种潜在抑制剂。Claude Science 与 BioNeMo Agent Toolkit 和 NVIDIA NIM 微服务集成,加速了高通量抑制剂的预测、优化和验证。
为代理构建的科学基础
AI 代理通过推理、规划和使用工具来完成任务。在生命科学领域,这些工具通常是专业的计算工作流。
一个自主的 AI 科学家代理并非孤立地进行推理。它可能需要对化合物库进行指纹识别,对有希望的命中进行聚类,为顶级候选物生成构象,分析基因组上下文,并比较扰动反应,然后才推荐下一项实验。
每一步都依赖于一个科学工具,而代理的运行速度仅限于这些工具的运行速度。
NVIDIA BioNeMo Agent Toolkit 为科学代理提供了以科学速度运行所需的加速工具。它包括:
NVIDIA BioNeMo Agent Toolkit 是开放的且不依赖于特定的框架,允许相同的科学技能跨代理框架和研究平台工作。该工具包及其技能现已通过 NVIDIA 开发者资源和 GitHub 获得。
科学家可以通过 Anthropic 的 Claude Science 访问 BioNeMo 驱动的工作流,该工具今天进入公开测试阶段。作为公开测试的一部分,Anthropic 正在邀请研究人员就他们需要的其他领域专家和集成提供反馈。
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mr. robul islam
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